De acordo com registros contidos nos livros-ata do Conselho Superior do APHRC, seguem os nomes dos ocupantes do cargo de Diretor/Superintendente da Autarquia:
Ana Maria de Almeida Camargo (21.11.1980 – 07.1990): nomeada Diretora pela Portaria nº 2.607, de 21 de novembro de 1980.
José Carlos Cardoso (28.07.1990 – 31.12.1992): empossado Diretor pelo Diretor do Departamento Jurídico, tendo sido continuamente reconduzido ao cargo por decisão dos conselheiros.
Eros Chizzotti (06.01.1993 – 12.1996): assume a Diretoria a convite do Presidente do Conselho, tendo sido continuamente reconduzido ao cargo por decisão dos conselheiros.
Maria Therezinha Duckur Mamprin (03.01.1997 – 31.12.2004): assume a Diretoria a partir de uma decisão do Prefeito Cláudio Antonio Di Mauro, que atendeu à sugestão expressa do Partido Verde, representado pela pessoa de Ned Saraiva Martins.
Djanira Ivete Mayer Gianotti (17.01.2005 – ?): assume a Diretoria partir de uma decisão do Prefeito Demerval da Fonseca Júnior., que atendeu à sugestão expressa do Conselho.
Ivani Bianchini Höfling (16.05.2005 – 31.12.2008): assume a Diretoria a partir de uma decisão do Prefeito Demerval da Fonseca Júnior.
Maria Teresa de Arruda Campos (12.01.2009 – 31.12.2016): assume a Superintendência a partir de uma decisão do Prefeito Palmínio Altimari Filho. Nomeada pela Portaria nº 10.496, de 12 de janeiro de 2009 e exonerada pela Portaria nº 14.447, de 26 de dezembro de 2016.
Monica Cristina Brunini Frandi Ferreira (01.01.2017 – atual): assume a Superintendência a partir de uma decisão do Prefeito João Teixeira Junior, em consulta à lista tríplice do Conselho Superior do APHRC. Nomeada pela Portaria nº 14.557, de 02 de janeiro de 2017 e exonerada pela Portaria nº 17.425, de 30 de dezembro de 2020. Reconduzida à Superintendência a partir de uma decisão do Prefeito Gustavo Ramos Perissonotto, em consulta à lista tríplice do Conselho Superior do APHRC. Nomeada pela Portaria nº 17.438, de 04 de janeiro de 2021.
De acordo com a Lei Complementar nº 0132, de 23 de maio de 2018, que “Reorganiza o Arquivo Público e Histórico do Município de Rio Claro,
“Oscar de Arruda Penteado”, e dá outras providências correlatas”, seguem os nomes dos servidores ocupantes dos cargos de Coordenadores da Autarquia, em função de confiança:
Consuelo Carolina Perinotto (29.05.2018 – 07.10.2021): Coordenadora de Difusão do Acervo. Portaria APHRC nº 063, de 29 de maio de 2018 e Portaria APHRC nº 104, de 07 de outubro de 2021.
Ednaldo Aparecido Rodrigues da Mata (29.05.2018 – atual): Coordenador de Arquivo Intermediário. Portaria APHRC nº 064, de 29 de maio de 2018.
Talita Gouvêa Basso (29.05.2018 – atual): Coordenadora de Arquivo Permanente. Portaria APHRC nº 065, de 29 de maio de 2018.
Carolina Hirai Suzuki (08.10.2021 – atual): Coordenadora de Difusão do Acervo. Portaria APHRC nº 108, de 07 de outubro de 2021.